בפרק ג' פונה חבקוק לקב"ה בבקשה כי ברגע שהוא רוגז על הבבלים, ירחם על עם ישראל שלא יכללו בפורענות שתבוא על בבל. בהמשך, מתאר הנביא כיצד ה' ילחם בגויים, יגלה את מלכותו בעולם וינכיח את השגחתו. לבסוף, מתאר הנביא כיצד הוא שמח בה' ובמעשיו ובטוח כי יעזור לישראל לנצח במלחמותיהם.