בפרק ג' מתאר הנביא כיצד הקב"ה יפרע מהגויים, אשר בחרו ללכת בדרך הרעה. לאחר מכן, מוכיח הנביא את ישראל ואומר שחשב שאולי ילמדו לקח מהפורענות בגויים, אך הם ממשיכים להשחית ולא ללכת בדרך ה', ולכן ביום ה' יפרע ה' מהחוטאים. לבסוף, מסיים צפניה בנבואת נחמה, ומתאר כיצד ה' יקבץ את עמו לאחר החורבן ויגאל את שארית העם מתוך אהבה ושמחה של הקב"ה בעמו.

צפניה - נבואות תוכחה
תוכחה חברתית
תוכחה למנהיגים
צפניה - נבואת נחמה
יום ה'
פורענות לגויים
מתוך שיעורים שהועברו בבית הכנסת בבית אל